Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk11bP24788 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk11bP24788 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms