Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr3aP23979 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr3aP23979 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms