Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pou3f1P21952 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms