Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms