Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TP20293 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TP20293 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TP20293 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TP20293 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TP20293 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TP20293 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TP20293 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms