Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cox5bP19536 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms