Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NefhP19246 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NefhP19246 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NefhP19246 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NefhP19246 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NefhP19246 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NefhP19246 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NefhP19246 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NefhP19246 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NefhP19246 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NefhP19246 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NefhP19246 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NefhP19246 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NefhP19246 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NefhP19246 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NefhP19246 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NefhP19246 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NefhP19246 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NefhP19246 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NefhP19246 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NefhP19246 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NefhP19246 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NefhP19246 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NefhP19246 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NefhP19246 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NefhP19246 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NefhP19246 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NefhP19246 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NefhP19246 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NefhP19246 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NefhP19246 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NefhP19246 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NefhP19246 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NefhP19246 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NefhP19246 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NefhP19246 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NefhP19246 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NefhP19246 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NefhP19246 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NefhP19246 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NefhP19246 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NefhP19246 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NefhP19246 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NefhP19246 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NefhP19246 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NefhP19246 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NefhP19246 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NefhP19246 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NefhP19246 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NefhP19246 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NefhP19246 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NefhP19246 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NefhP19246 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NefhP19246 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NefhP19246 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NefhP19246 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NefhP19246 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NefhP19246 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NefhP19246 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NefhP19246 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NefhP19246 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NefhP19246 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms