Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ifrd1P19182 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms