Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms