Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18533 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18533 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18533 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18533 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18533 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18533 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18533 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18533 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18533 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18533 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18533 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18533 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18533 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18533 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18533 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18533 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18533 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18533 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms