Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms