Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chrm1P12657 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrm1P12657 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms