Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OtcP11725 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OtcP11725 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OtcP11725 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OtcP11725 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OtcP11725 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtcP11725 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtcP11725 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtcP11725 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtcP11725 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtcP11725 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OtcP11725 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms