Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Amd1P0DMN7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Amd1P0DMN7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms