Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Egr1P08046 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr1P08046 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms