Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-T23P06339 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-T23P06339 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms