Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06336 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06336 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06336 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06336 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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