Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms