Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01669 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01669 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01669 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01669 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01669 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01669 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01669 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01669 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01669 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01669 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01669 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01669 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
P01669 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01669 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01669 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P01669 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01669 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01669 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01669 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01669 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01669 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01669 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01669 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01669 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01669 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01669 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01669 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01669 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01669 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms