Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01641 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01641 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01641 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01641 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01641 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01641 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01641 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms