Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01629 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01629 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01629 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01629 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01629 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01629 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms