Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sypl2O89104 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sypl2O89104 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms