Protein–RNA interactions for Protein: O88466

Znf106, Zinc finger protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf106O88466 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf106O88466 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Znf106O88466 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf106O88466 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Znf106O88466 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf106O88466 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms