Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Tnnt1O88346 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnnt1O88346 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnnt1O88346 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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