Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd46O88174 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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