Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcn4O70507 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcn4O70507 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms