Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrna4O70174 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms