Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms