Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc3O55013 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc3O55013 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms