Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TsksO54887 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TsksO54887 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsksO54887 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsksO54887 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsksO54887 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsksO54887 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsksO54887 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TsksO54887 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsksO54887 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsksO54887 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsksO54887 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsksO54887 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TsksO54887 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TsksO54887 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TsksO54887 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TsksO54887 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TsksO54887 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TsksO54887 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TsksO54887 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TsksO54887 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TsksO54887 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TsksO54887 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TsksO54887 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TsksO54887 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TsksO54887 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms