Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk5r2O35926 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms