Protein–RNA interactions for Protein: O35723

Dnajb3, DnaJ homolog subfamily B member 3, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb3O35723 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Dnajb3O35723 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dnajb3O35723 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms