Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfrsf18O35714 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfrsf18O35714 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms