Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Notch2O35516 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms