Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccrl2O35457 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccrl2O35457 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms