Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atf6bO35451 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms