Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppt2O35448 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppt2O35448 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms