Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppef2O35385 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppef2O35385 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppef2O35385 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppef2O35385 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppef2O35385 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppef2O35385 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppef2O35385 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppef2O35385 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppef2O35385 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppef2O35385 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppef2O35385 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms