Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srsf5O35326 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Srsf5O35326 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms