Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkd2O35245 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms