Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bhlhe40O35185 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms