Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckarO08786 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckarO08786 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckarO08786 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckarO08786 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms