Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcof1O08784 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcof1O08784 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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