Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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MttpO08601 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MttpO08601 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MttpO08601 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MttpO08601 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MttpO08601 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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MttpO08601 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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MttpO08601 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MttpO08601 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MttpO08601 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MttpO08601 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MttpO08601 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MttpO08601 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MttpO08601 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MttpO08601 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MttpO08601 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MttpO08601 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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MttpO08601 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MttpO08601 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MttpO08601 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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MttpO08601 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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MttpO08601 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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MttpO08601 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MttpO08601 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms