Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp35M0QWN7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms