Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm8050L7N2E3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms