Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r88L7N1W8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms