Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5225J3QPL3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm5225J3QPL3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms