Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Top6blJ3QMY9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Top6blJ3QMY9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms