Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm3727J3QM54 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm3727J3QM54 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm3727J3QM54 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3727J3QM54 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3727J3QM54 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3727J3QM54 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm3727J3QM54 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm3727J3QM54 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3727J3QM54 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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